Protein–RNA interactions for Protein: P78337

PITX1, Pituitary homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1P78337 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITX1P78337 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITX1P78337 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PITX1P78337 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITX1P78337 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITX1P78337 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PITX1P78337 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX1P78337 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX1P78337 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX1P78337 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX1P78337 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX1P78337 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX1P78337 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX1P78337 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX1P78337 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX1P78337 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PITX1P78337 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITX1P78337 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PITX1P78337 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITX1P78337 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITX1P78337 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITX1P78337 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PITX1P78337 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PITX1P78337 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PITX1P78337 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PITX1P78337 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PITX1P78337 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITX1P78337 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITX1P78337 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITX1P78337 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITX1P78337 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITX1P78337 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITX1P78337 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PITX1P78337 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITX1P78337 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITX1P78337 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITX1P78337 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITX1P78337 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITX1P78337 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PITX1P78337 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITX1P78337 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PITX1P78337 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PITX1P78337 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX1P78337 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX1P78337 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX1P78337 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX1P78337 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX1P78337 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX1P78337 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX1P78337 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX1P78337 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX1P78337 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PITX1P78337 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITX1P78337 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITX1P78337 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITX1P78337 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITX1P78337 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITX1P78337 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITX1P78337 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITX1P78337 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PITX1P78337 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITX1P78337 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITX1P78337 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITX1P78337 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PITX1P78337 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PITX1P78337 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PITX1P78337 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PITX1P78337 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PITX1P78337 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITX1P78337 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITX1P78337 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITX1P78337 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITX1P78337 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITX1P78337 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PITX1P78337 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITX1P78337 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITX1P78337 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PITX1P78337 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PITX1P78337 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITX1P78337 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITX1P78337 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITX1P78337 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITX1P78337 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITX1P78337 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITX1P78337 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITX1P78337 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PITX1P78337 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PITX1P78337 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms