Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SNAP25P60880 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SNAP25P60880 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SNAP25P60880 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms