Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTENP60484 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTENP60484 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTENP60484 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTENP60484 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTENP60484 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTENP60484 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTENP60484 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTENP60484 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTENP60484 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTENP60484 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTENP60484 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTENP60484 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTENP60484 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTENP60484 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTENP60484 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTENP60484 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTENP60484 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTENP60484 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTENP60484 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTENP60484 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTENP60484 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTENP60484 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTENP60484 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTENP60484 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTENP60484 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTENP60484 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTENP60484 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTENP60484 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTENP60484 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTENP60484 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTENP60484 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTENP60484 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTENP60484 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTENP60484 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTENP60484 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTENP60484 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTENP60484 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTENP60484 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTENP60484 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTENP60484 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTENP60484 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTENP60484 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTENP60484 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTENP60484 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTENP60484 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PTENP60484 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTENP60484 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTENP60484 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTENP60484 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTENP60484 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTENP60484 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTENP60484 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTENP60484 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTENP60484 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTENP60484 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTENP60484 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTENP60484 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTENP60484 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTENP60484 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PTENP60484 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTENP60484 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTENP60484 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTENP60484 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTENP60484 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTENP60484 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTENP60484 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTENP60484 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTENP60484 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTENP60484 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTENP60484 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTENP60484 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTENP60484 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTENP60484 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTENP60484 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTENP60484 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTENP60484 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTENP60484 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTENP60484 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTENP60484 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTENP60484 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTENP60484 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTENP60484 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PTENP60484 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTENP60484 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTENP60484 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTENP60484 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTENP60484 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTENP60484 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTENP60484 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTENP60484 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
PTENP60484 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTENP60484 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTENP60484 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTENP60484 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTENP60484 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTENP60484 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTENP60484 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTENP60484 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
PTENP60484 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms