Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CHMP4BP1P59074 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CHMP4BP1P59074 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
CHMP4BP1P59074 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms