Protein–RNA interactions for Protein: P56589

PEX3, Peroxisomal biogenesis factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX3P56589 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX3P56589 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX3P56589 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX3P56589 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PEX3P56589 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX3P56589 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX3P56589 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX3P56589 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PEX3P56589 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX3P56589 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX3P56589 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX3P56589 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX3P56589 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX3P56589 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX3P56589 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PEX3P56589 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX3P56589 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX3P56589 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX3P56589 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX3P56589 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PEX3P56589 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX3P56589 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX3P56589 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PEX3P56589 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX3P56589 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX3P56589 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX3P56589 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX3P56589 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX3P56589 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PEX3P56589 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX3P56589 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX3P56589 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX3P56589 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PEX3P56589 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX3P56589 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX3P56589 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX3P56589 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX3P56589 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX3P56589 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX3P56589 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX3P56589 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX3P56589 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX3P56589 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX3P56589 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PEX3P56589 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX3P56589 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX3P56589 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX3P56589 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX3P56589 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX3P56589 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX3P56589 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PEX3P56589 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX3P56589 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX3P56589 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX3P56589 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PEX3P56589 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX3P56589 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX3P56589 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX3P56589 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX3P56589 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX3P56589 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX3P56589 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX3P56589 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX3P56589 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX3P56589 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX3P56589 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PEX3P56589 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PEX3P56589 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PEX3P56589 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PEX3P56589 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PEX3P56589 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX3P56589 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX3P56589 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PEX3P56589 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PEX3P56589 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX3P56589 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX3P56589 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PEX3P56589 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX3P56589 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX3P56589 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX3P56589 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX3P56589 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX3P56589 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX3P56589 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX3P56589 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX3P56589 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX3P56589 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PEX3P56589 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX3P56589 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX3P56589 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX3P56589 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX3P56589 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX3P56589 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PEX3P56589 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX3P56589 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX3P56589 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX3P56589 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX3P56589 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX3P56589 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PEX3P56589 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms