Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SUMO3P55854 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SUMO3P55854 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SUMO3P55854 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms