Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARFIP1P53367 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARFIP1P53367 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARFIP1P53367 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms