Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LBX1P52954 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LBX1P52954 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LBX1P52954 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LBX1P52954 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LBX1P52954 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LBX1P52954 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LBX1P52954 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LBX1P52954 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LBX1P52954 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LBX1P52954 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LBX1P52954 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LBX1P52954 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LBX1P52954 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LBX1P52954 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX1P52954 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX1P52954 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX1P52954 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX1P52954 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX1P52954 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX1P52954 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LBX1P52954 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LBX1P52954 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LBX1P52954 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LBX1P52954 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LBX1P52954 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LBX1P52954 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LBX1P52954 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LBX1P52954 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LBX1P52954 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LBX1P52954 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX1P52954 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX1P52954 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX1P52954 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX1P52954 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX1P52954 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX1P52954 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX1P52954 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LBX1P52954 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LBX1P52954 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LBX1P52954 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LBX1P52954 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LBX1P52954 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LBX1P52954 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LBX1P52954 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LBX1P52954 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
LBX1P52954 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX1P52954 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX1P52954 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX1P52954 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX1P52954 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX1P52954 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX1P52954 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX1P52954 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX1P52954 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LBX1P52954 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX1P52954 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX1P52954 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX1P52954 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LBX1P52954 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX1P52954 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX1P52954 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX1P52954 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX1P52954 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX1P52954 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LBX1P52954 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX1P52954 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX1P52954 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX1P52954 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LBX1P52954 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX1P52954 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX1P52954 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX1P52954 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX1P52954 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX1P52954 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX1P52954 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX1P52954 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX1P52954 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LBX1P52954 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX1P52954 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX1P52954 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX1P52954 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX1P52954 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX1P52954 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LBX1P52954 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LBX1P52954 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LBX1P52954 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX1P52954 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX1P52954 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX1P52954 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX1P52954 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX1P52954 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LBX1P52954 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX1P52954 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX1P52954 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX1P52954 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX1P52954 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX1P52954 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX1P52954 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
LBX1P52954 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms