Protein–RNA interactions for Protein: P51170

SCNN1G, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1GP51170 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SCNN1GP51170 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCNN1GP51170 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCNN1GP51170 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms