Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRE11P49959 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRE11P49959 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRE11P49959 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRE11P49959 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRE11P49959 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRE11P49959 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRE11P49959 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MRE11P49959 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRE11P49959 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRE11P49959 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRE11P49959 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRE11P49959 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRE11P49959 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRE11P49959 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRE11P49959 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MRE11P49959 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MRE11P49959 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRE11P49959 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MRE11P49959 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRE11P49959 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MRE11P49959 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRE11P49959 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRE11P49959 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRE11P49959 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRE11P49959 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRE11P49959 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRE11P49959 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MRE11P49959 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
MRE11P49959 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRE11P49959 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRE11P49959 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRE11P49959 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRE11P49959 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRE11P49959 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MRE11P49959 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRE11P49959 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRE11P49959 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRE11P49959 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MRE11P49959 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MRE11P49959 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRE11P49959 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRE11P49959 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRE11P49959 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRE11P49959 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MRE11P49959 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRE11P49959 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRE11P49959 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MRE11P49959 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRE11P49959 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRE11P49959 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRE11P49959 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRE11P49959 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MRE11P49959 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRE11P49959 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRE11P49959 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MRE11P49959 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MRE11P49959 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRE11P49959 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRE11P49959 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRE11P49959 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRE11P49959 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRE11P49959 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRE11P49959 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRE11P49959 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRE11P49959 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MRE11P49959 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRE11P49959 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRE11P49959 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MRE11P49959 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRE11P49959 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MRE11P49959 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MRE11P49959 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRE11P49959 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRE11P49959 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRE11P49959 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRE11P49959 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRE11P49959 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRE11P49959 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRE11P49959 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRE11P49959 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRE11P49959 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRE11P49959 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRE11P49959 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRE11P49959 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRE11P49959 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms