Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK8P49336 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK8P49336 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK8P49336 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK8P49336 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDK8P49336 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK8P49336 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK8P49336 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK8P49336 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK8P49336 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDK8P49336 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK8P49336 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK8P49336 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK8P49336 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK8P49336 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK8P49336 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK8P49336 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK8P49336 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDK8P49336 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK8P49336 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK8P49336 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK8P49336 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK8P49336 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK8P49336 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK8P49336 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDK8P49336 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK8P49336 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK8P49336 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK8P49336 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK8P49336 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDK8P49336 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK8P49336 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK8P49336 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK8P49336 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK8P49336 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK8P49336 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK8P49336 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK8P49336 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK8P49336 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK8P49336 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDK8P49336 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK8P49336 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK8P49336 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK8P49336 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDK8P49336 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK8P49336 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK8P49336 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK8P49336 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK8P49336 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK8P49336 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDK8P49336 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK8P49336 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK8P49336 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK8P49336 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDK8P49336 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK8P49336 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK8P49336 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK8P49336 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK8P49336 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK8P49336 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK8P49336 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDK8P49336 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK8P49336 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK8P49336 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK8P49336 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDK8P49336 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK8P49336 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK8P49336 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK8P49336 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK8P49336 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDK8P49336 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK8P49336 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK8P49336 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK8P49336 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK8P49336 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK8P49336 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDK8P49336 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK8P49336 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK8P49336 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDK8P49336 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK8P49336 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK8P49336 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK8P49336 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK8P49336 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK8P49336 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK8P49336 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK8P49336 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK8P49336 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDK8P49336 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK8P49336 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK8P49336 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK8P49336 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK8P49336 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK8P49336 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK8P49336 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDK8P49336 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK8P49336 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK8P49336 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK8P49336 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDK8P49336 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms