Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PITPNBP48739 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
PITPNBP48739 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PITPNBP48739 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms