Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCLCP48506 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCLCP48506 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCLCP48506 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCLCP48506 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GCLCP48506 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCLCP48506 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GCLCP48506 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCLCP48506 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
GCLCP48506 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GCLCP48506 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCLCP48506 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCLCP48506 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCLCP48506 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCLCP48506 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCLCP48506 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GCLCP48506 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
GCLCP48506 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCLCP48506 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GCLCP48506 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCLCP48506 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCLCP48506 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCLCP48506 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GCLCP48506 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
GCLCP48506 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCLCP48506 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCLCP48506 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCLCP48506 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCLCP48506 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCLCP48506 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GCLCP48506 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCLCP48506 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCLCP48506 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
GCLCP48506 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCLCP48506 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCLCP48506 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
GCLCP48506 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCLCP48506 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCLCP48506 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GCLCP48506 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCLCP48506 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCLCP48506 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GCLCP48506 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLCP48506 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLCP48506 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLCP48506 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLCP48506 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLCP48506 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLCP48506 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
GCLCP48506 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCLCP48506 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCLCP48506 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCLCP48506 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GCLCP48506 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCLCP48506 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCLCP48506 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCLCP48506 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GCLCP48506 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GCLCP48506 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCLCP48506 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCLCP48506 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GCLCP48506 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCLCP48506 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCLCP48506 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCLCP48506 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCLCP48506 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCLCP48506 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCLCP48506 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCLCP48506 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GCLCP48506 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCLCP48506 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCLCP48506 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCLCP48506 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GCLCP48506 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCLCP48506 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCLCP48506 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCLCP48506 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GCLCP48506 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCLCP48506 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GCLCP48506 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCLCP48506 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCLCP48506 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GCLCP48506 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GCLCP48506 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCLCP48506 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GCLCP48506 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCLCP48506 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCLCP48506 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCLCP48506 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCLCP48506 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCLCP48506 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCLCP48506 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCLCP48506 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GCLCP48506 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCLCP48506 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCLCP48506 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GCLCP48506 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GCLCP48506 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GCLCP48506 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
GCLCP48506 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms