Protein–RNA interactions for Protein: P48380

RFX3, Transcription factor RFX3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3P48380 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX3P48380 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX3P48380 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX3P48380 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RFX3P48380 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX3P48380 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RFX3P48380 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RFX3P48380 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX3P48380 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX3P48380 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX3P48380 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX3P48380 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX3P48380 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RFX3P48380 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX3P48380 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX3P48380 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX3P48380 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX3P48380 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX3P48380 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RFX3P48380 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX3P48380 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX3P48380 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX3P48380 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX3P48380 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX3P48380 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX3P48380 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX3P48380 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RFX3P48380 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RFX3P48380 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX3P48380 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX3P48380 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX3P48380 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX3P48380 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX3P48380 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX3P48380 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX3P48380 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX3P48380 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RFX3P48380 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX3P48380 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX3P48380 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX3P48380 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX3P48380 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX3P48380 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX3P48380 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX3P48380 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RFX3P48380 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX3P48380 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX3P48380 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX3P48380 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX3P48380 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX3P48380 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX3P48380 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
RFX3P48380 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RFX3P48380 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX3P48380 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX3P48380 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX3P48380 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX3P48380 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX3P48380 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX3P48380 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX3P48380 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX3P48380 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RFX3P48380 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX3P48380 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX3P48380 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX3P48380 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX3P48380 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX3P48380 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX3P48380 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX3P48380 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX3P48380 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RFX3P48380 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFX3P48380 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RFX3P48380 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX3P48380 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX3P48380 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX3P48380 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RFX3P48380 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98 ms