Protein–RNA interactions for Protein: P47972

NPTX2, Neuronal pentraxin-2, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX2P47972 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
NPTX2P47972 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NPTX2P47972 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NPTX2P47972 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms