Protein–RNA interactions for Protein: P46778

RPL21, 60S ribosomal protein L21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL21P46778 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL21P46778 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL21P46778 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL21P46778 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL21P46778 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL21P46778 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL21P46778 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL21P46778 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL21P46778 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL21P46778 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL21P46778 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL21P46778 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL21P46778 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL21P46778 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL21P46778 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL21P46778 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL21P46778 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL21P46778 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL21P46778 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL21P46778 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL21P46778 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL21P46778 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL21P46778 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL21P46778 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL21P46778 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL21P46778 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL21P46778 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL21P46778 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPL21P46778 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL21P46778 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL21P46778 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL21P46778 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL21P46778 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPL21P46778 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL21P46778 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL21P46778 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL21P46778 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL21P46778 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL21P46778 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL21P46778 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPL21P46778 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPL21P46778 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL21P46778 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL21P46778 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL21P46778 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL21P46778 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL21P46778 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL21P46778 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL21P46778 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL21P46778 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL21P46778 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPL21P46778 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL21P46778 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL21P46778 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL21P46778 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL21P46778 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL21P46778 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL21P46778 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPL21P46778 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPL21P46778 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPL21P46778 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPL21P46778 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL21P46778 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL21P46778 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL21P46778 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL21P46778 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL21P46778 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL21P46778 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL21P46778 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL21P46778 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL21P46778 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPL21P46778 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL21P46778 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL21P46778 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL21P46778 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL21P46778 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPL21P46778 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL21P46778 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL21P46778 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL21P46778 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL21P46778 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPL21P46778 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL21P46778 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL21P46778 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL21P46778 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPL21P46778 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms