Protein–RNA interactions for Protein: P46736

BRCC3, Lys-63-specific deubiquitinase BRCC36, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCC3P46736 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRCC3P46736 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BRCC3P46736 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BRCC3P46736 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms