Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ACADSBP45954 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ACADSBP45954 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ACADSBP45954 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.2 ms