Protein–RNA interactions for Protein: P43005

SLC1A1, Excitatory amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A1P43005 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC1A1P43005 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SLC1A1P43005 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SLC1A1P43005 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms