Protein–RNA interactions for Protein: P40347

LTP1, Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, yeastyeast

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LTP1P40347 PMT2YAL023C 2280 nt5.71□□□□□ -1.5
LTP1P40347 UBX2YML013W 1755 nt5.71□□□□□ -1.5
LTP1P40347 EFM4YIL064W 774 nt5.71□□□□□ -1.5
LTP1P40347 POP5YAL033W 522 nt5.71□□□□□ -1.5
LTP1P40347 VPS28YPL065W 729 nt5.71□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YMC1YPR058W 924 nt5.71□□□□□ -1.5
LTP1P40347 POP1YNL221C 2628 nt5.71□□□□□ -1.5
LTP1P40347 VMA2YBR127C 1554 nt5.71□□□□□ -1.5
LTP1P40347 EXG1YLR300W 1347 nt5.71□□□□□ -1.5
LTP1P40347 MPP10YJR002W 1782 nt5.7□□□□□ -1.5
LTP1P40347 PYK2YOR347C 1521 nt5.7□□□□□ -1.5
LTP1P40347 TRR1YDR353W 960 nt5.7□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YER137CYER137C 447 nt5.7□□□□□ -1.5
LTP1P40347 SYN8YAL014C 768 nt5.7□□□□□ -1.5
LTP1P40347 MRP17YKL003C 396 nt5.7□□□□□ -1.5
LTP1P40347 APN1YKL114C 1104 nt5.7□□□□□ -1.5
LTP1P40347 TPO3YPR156C 1869 nt5.7□□□□□ -1.5
LTP1P40347 PRT1YOR361C 2292 nt5.69□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YGR022CYGR022C 330 nt5.69□□□□□ -1.5
LTP1P40347 QCR8YJL166W 285 nt5.69□□□□□ -1.5
LTP1P40347 CCP1YKR066C 1086 nt5.69□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YLR123CYLR123C 330 nt5.69□□□□□ -1.5
LTP1P40347 TIF34YMR146C 1044 nt5.69□□□□□ -1.5
LTP1P40347 CYB2YML054C 1776 nt5.69□□□□□ -1.5
LTP1P40347 PYC1YGL062W 3537 nt5.69□□□□□ -1.5
LTP1P40347 AAP1YHR047C 2571 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 NUD1YOR373W 2556 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YML133CYML133C 4125 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YCK1YHR135C 1617 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 ADY2YCR010C 852 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YDR396WYDR396W 501 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 TPK1YJL164C 1194 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 DBR1YKL149C 1218 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 RRT7YLL030C 342 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 PNP1YLR209C 936 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 TSA1YML028W 591 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 AIM33YML087C 939 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 RUF21RUF21 707 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YNR048WYNR048W 1182 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 WHI2YOR043W 1461 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 FAA4YMR246W 2085 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 ISR1YPR106W 1332 nt5.68□□□□□ -1.5
LTP1P40347 HOF1YMR032W 2010 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 MDH3YDL078C 1032 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 IPK1YDR315C 846 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 THI4YGR144W 981 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YHR095WYHR095W 495 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YIL077CYIL077C 963 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 SPC24YMR117C 642 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 IES2YNL215W 963 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YOL079WYOL079W 399 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 CWC27YPL064C 906 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 ERI1YPL096C-A 207 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 KTR3YBR205W 1215 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 RAD24YER173W 1980 nt5.67□□□□□ -1.5
LTP1P40347 ATR1YML116W 1629 nt5.66□□□□□ -1.5
LTP1P40347 RTT103YDR289C 1230 nt5.66□□□□□ -1.5
LTP1P40347 SED5YLR026C 1023 nt5.66□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YMR030W-AYMR030W-A 291 nt5.66□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YPR114WYPR114W 948 nt5.66□□□□□ -1.5
LTP1P40347 CTS2YDR371W 1536 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YDL157CYDL157C 357 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 HHY1YEL059W 309 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YFL064CYFL064C 525 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 VAM7YGL212W 951 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 SEC13YLR208W 894 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 DIA1YMR316W 1011 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 UBC11YOR339C 471 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 RPL5YPL131W 894 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 POS5YPL188W 1245 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 YPR202WYPR202W 717 nt5.65□□□□□ -1.5
LTP1P40347 HXT2YMR011W 1626 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 SUF5tG(CCC)O 72 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 GTT3YEL017W 1014 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 YGR127WYGR127W 939 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 VMA16YHR026W 642 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 DYS1YHR068W 1164 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 NTG1YAL015C 1200 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 YKL107WYKL107W 930 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 ADD37YMR184W 597 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 FRE7YOL152W 1863 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 MMR1YLR190W 1476 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 UGO1YDR470C 1509 nt5.64□□□□□ -1.51
LTP1P40347 RAM1YDL090C 1296 nt5.63□□□□□ -1.51
LTP1P40347 TMT1YER175C 900 nt5.63□□□□□ -1.51
LTP1P40347 MAD2YJL030W 591 nt5.63□□□□□ -1.51
LTP1P40347 ARG1YOL058W 1263 nt5.63□□□□□ -1.51
LTP1P40347 AME1YBR211C 975 nt5.63□□□□□ -1.51
LTP1P40347 PEX34YCL056C 435 nt5.63□□□□□ -1.51
LTP1P40347 CRP1YHR146W 1398 nt5.63□□□□□ -1.51
LTP1P40347 SVF1YDR346C 1446 nt5.63□□□□□ -1.51
LTP1P40347 CNE1YAL058W 1509 nt5.63□□□□□ -1.51
LTP1P40347 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt5.62□□□□□ -1.51
LTP1P40347 COX3Q0275 810 nt5.62□□□□□ -1.51
LTP1P40347 LDB18YLL049W 540 nt5.62□□□□□ -1.51
LTP1P40347 DCN1YLR128W 810 nt5.62□□□□□ -1.51
LTP1P40347 YLR283WYLR283W 945 nt5.62□□□□□ -1.51
LTP1P40347 NMD4YLR363C 657 nt5.62□□□□□ -1.51
LTP1P40347 FES1YBR101C 873 nt5.62□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 100.1 ms