Protein–RNA interactions for Protein: P35663

CYLC1, Cylicin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLC1P35663 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CYLC1P35663 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CYLC1P35663 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CYLC1P35663 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.7 ms