Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGER1P34995 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGER1P34995 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PTGER1P34995 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms