Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA1P27694 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA1P27694 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA1P27694 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA1P27694 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA1P27694 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA1P27694 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA1P27694 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RPA1P27694 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
RPA1P27694 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
RPA1P27694 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPA1P27694 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RPA1P27694 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RPA1P27694 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPA1P27694 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPA1P27694 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPA1P27694 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPA1P27694 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPA1P27694 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
RPA1P27694 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
RPA1P27694 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPA1P27694 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPA1P27694 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPA1P27694 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPA1P27694 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
RPA1P27694 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
RPA1P27694 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA1P27694 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA1P27694 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA1P27694 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA1P27694 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA1P27694 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA1P27694 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA1P27694 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA1P27694 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA1P27694 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA1P27694 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
RPA1P27694 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPA1P27694 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPA1P27694 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPA1P27694 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPA1P27694 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
RPA1P27694 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPA1P27694 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
RPA1P27694 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPA1P27694 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPA1P27694 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPA1P27694 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPA1P27694 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPA1P27694 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPA1P27694 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
RPA1P27694 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA1P27694 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA1P27694 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA1P27694 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA1P27694 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA1P27694 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA1P27694 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA1P27694 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
RPA1P27694 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPA1P27694 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPA1P27694 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPA1P27694 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
RPA1P27694 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA1P27694 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA1P27694 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA1P27694 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA1P27694 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA1P27694 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
RPA1P27694 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPA1P27694 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPA1P27694 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPA1P27694 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RPA1P27694 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
RPA1P27694 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
RPA1P27694 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms