Protein–RNA interactions for Protein: P25024

CXCR1, C-X-C chemokine receptor type 1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR1P25024 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CXCR1P25024 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCR1P25024 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms