Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ATP5F1P24539 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ATP5F1P24539 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ATP5F1P24539 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms