Protein–RNA interactions for Protein: P23760

PAX3, Paired box protein Pax-3, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX3P23760 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX3P23760 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX3P23760 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX3P23760 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX3P23760 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PAX3P23760 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAX3P23760 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAX3P23760 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAX3P23760 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAX3P23760 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAX3P23760 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PAX3P23760 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAX3P23760 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAX3P23760 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PAX3P23760 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PAX3P23760 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX3P23760 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX3P23760 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PAX3P23760 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PAX3P23760 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
PAX3P23760 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX3P23760 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX3P23760 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX3P23760 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX3P23760 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX3P23760 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX3P23760 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX3P23760 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX3P23760 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PAX3P23760 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAX3P23760 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAX3P23760 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAX3P23760 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAX3P23760 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAX3P23760 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAX3P23760 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAX3P23760 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAX3P23760 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PAX3P23760 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX3P23760 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX3P23760 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX3P23760 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX3P23760 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX3P23760 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX3P23760 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX3P23760 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX3P23760 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX3P23760 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX3P23760 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PAX3P23760 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX3P23760 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX3P23760 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX3P23760 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX3P23760 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX3P23760 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX3P23760 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX3P23760 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PAX3P23760 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX3P23760 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX3P23760 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX3P23760 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX3P23760 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX3P23760 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX3P23760 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX3P23760 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX3P23760 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX3P23760 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX3P23760 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PAX3P23760 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX3P23760 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX3P23760 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX3P23760 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX3P23760 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX3P23760 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX3P23760 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX3P23760 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX3P23760 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX3P23760 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PAX3P23760 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAX3P23760 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAX3P23760 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAX3P23760 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAX3P23760 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAX3P23760 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PAX3P23760 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAX3P23760 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PAX3P23760 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX3P23760 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX3P23760 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX3P23760 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX3P23760 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX3P23760 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX3P23760 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX3P23760 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX3P23760 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX3P23760 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PAX3P23760 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAX3P23760 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAX3P23760 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PAX3P23760 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms