Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASTP20810 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASTP20810 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASTP20810 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CASTP20810 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASTP20810 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASTP20810 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CASTP20810 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASTP20810 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASTP20810 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASTP20810 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASTP20810 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASTP20810 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CASTP20810 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASTP20810 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASTP20810 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASTP20810 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CASTP20810 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASTP20810 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CASTP20810 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CASTP20810 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CASTP20810 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASTP20810 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASTP20810 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASTP20810 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASTP20810 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CASTP20810 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASTP20810 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASTP20810 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASTP20810 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASTP20810 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CASTP20810 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASTP20810 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASTP20810 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CASTP20810 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASTP20810 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASTP20810 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CASTP20810 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASTP20810 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASTP20810 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASTP20810 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASTP20810 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASTP20810 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CASTP20810 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASTP20810 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CASTP20810 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASTP20810 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CASTP20810 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CASTP20810 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASTP20810 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASTP20810 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASTP20810 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASTP20810 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASTP20810 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASTP20810 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CASTP20810 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASTP20810 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASTP20810 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASTP20810 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASTP20810 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASTP20810 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASTP20810 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CASTP20810 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CASTP20810 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CASTP20810 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASTP20810 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASTP20810 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASTP20810 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASTP20810 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CASTP20810 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASTP20810 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASTP20810 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASTP20810 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CASTP20810 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASTP20810 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CASTP20810 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CASTP20810 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CASTP20810 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASTP20810 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CASTP20810 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CASTP20810 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASTP20810 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASTP20810 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASTP20810 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASTP20810 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASTP20810 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASTP20810 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CASTP20810 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASTP20810 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASTP20810 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASTP20810 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASTP20810 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CASTP20810 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASTP20810 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASTP20810 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASTP20810 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASTP20810 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASTP20810 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASTP20810 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CASTP20810 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms