Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFE3P19532 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TFE3P19532 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFE3P19532 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFE3P19532 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFE3P19532 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
TFE3P19532 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFE3P19532 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFE3P19532 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFE3P19532 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFE3P19532 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TFE3P19532 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFE3P19532 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TFE3P19532 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFE3P19532 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFE3P19532 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFE3P19532 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFE3P19532 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TFE3P19532 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TFE3P19532 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TFE3P19532 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFE3P19532 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TFE3P19532 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFE3P19532 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFE3P19532 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFE3P19532 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFE3P19532 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TFE3P19532 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TFE3P19532 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFE3P19532 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFE3P19532 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFE3P19532 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFE3P19532 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TFE3P19532 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFE3P19532 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFE3P19532 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFE3P19532 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFE3P19532 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFE3P19532 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFE3P19532 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFE3P19532 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TFE3P19532 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TFE3P19532 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFE3P19532 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TFE3P19532 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFE3P19532 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFE3P19532 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFE3P19532 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TFE3P19532 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFE3P19532 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFE3P19532 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TFE3P19532 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFE3P19532 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFE3P19532 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TFE3P19532 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFE3P19532 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFE3P19532 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFE3P19532 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFE3P19532 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFE3P19532 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFE3P19532 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFE3P19532 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFE3P19532 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFE3P19532 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFE3P19532 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TFE3P19532 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFE3P19532 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFE3P19532 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFE3P19532 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TFE3P19532 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFE3P19532 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFE3P19532 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFE3P19532 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFE3P19532 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFE3P19532 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFE3P19532 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TFE3P19532 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms