Protein–RNA interactions for Protein: P19237

TNNI1, Troponin I, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI1P19237 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TNNI1P19237 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TNNI1P19237 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TNNI1P19237 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms