Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDCP19113 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDCP19113 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDCP19113 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDCP19113 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDCP19113 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDCP19113 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDCP19113 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HDCP19113 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDCP19113 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDCP19113 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDCP19113 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDCP19113 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDCP19113 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDCP19113 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDCP19113 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDCP19113 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDCP19113 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDCP19113 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDCP19113 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDCP19113 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDCP19113 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDCP19113 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDCP19113 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDCP19113 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDCP19113 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDCP19113 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDCP19113 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDCP19113 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDCP19113 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDCP19113 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDCP19113 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HDCP19113 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDCP19113 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HDCP19113 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HDCP19113 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDCP19113 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDCP19113 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDCP19113 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HDCP19113 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDCP19113 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDCP19113 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDCP19113 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDCP19113 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDCP19113 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDCP19113 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDCP19113 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HDCP19113 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HDCP19113 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDCP19113 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HDCP19113 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDCP19113 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDCP19113 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDCP19113 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HDCP19113 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDCP19113 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
HDCP19113 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDCP19113 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HDCP19113 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HDCP19113 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDCP19113 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDCP19113 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDCP19113 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDCP19113 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HDCP19113 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HDCP19113 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDCP19113 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDCP19113 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
HDCP19113 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDCP19113 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HDCP19113 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDCP19113 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDCP19113 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDCP19113 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDCP19113 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDCP19113 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HDCP19113 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HDCP19113 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDCP19113 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDCP19113 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDCP19113 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDCP19113 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDCP19113 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HDCP19113 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDCP19113 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDCP19113 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDCP19113 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
HDCP19113 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HDCP19113 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms