Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
COX6A1P12074 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COX6A1P12074 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COX6A1P12074 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms