Protein–RNA interactions for Protein: P11926

ODC1, Ornithine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1P11926 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODC1P11926 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODC1P11926 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ODC1P11926 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ODC1P11926 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ODC1P11926 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ODC1P11926 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ODC1P11926 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ODC1P11926 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ODC1P11926 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ODC1P11926 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ODC1P11926 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ODC1P11926 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ODC1P11926 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ODC1P11926 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ODC1P11926 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ODC1P11926 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ODC1P11926 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ODC1P11926 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ODC1P11926 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ODC1P11926 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ODC1P11926 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ODC1P11926 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ODC1P11926 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ODC1P11926 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODC1P11926 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODC1P11926 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODC1P11926 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODC1P11926 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODC1P11926 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODC1P11926 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODC1P11926 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ODC1P11926 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ODC1P11926 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ODC1P11926 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ODC1P11926 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODC1P11926 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODC1P11926 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODC1P11926 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ODC1P11926 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODC1P11926 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODC1P11926 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ODC1P11926 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODC1P11926 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODC1P11926 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODC1P11926 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ODC1P11926 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ODC1P11926 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ODC1P11926 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ODC1P11926 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ODC1P11926 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODC1P11926 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODC1P11926 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODC1P11926 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODC1P11926 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ODC1P11926 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ODC1P11926 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ODC1P11926 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ODC1P11926 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ODC1P11926 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ODC1P11926 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ODC1P11926 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ODC1P11926 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODC1P11926 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODC1P11926 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODC1P11926 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODC1P11926 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ODC1P11926 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODC1P11926 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ODC1P11926 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODC1P11926 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODC1P11926 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODC1P11926 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ODC1P11926 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODC1P11926 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ODC1P11926 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ODC1P11926 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ODC1P11926 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ODC1P11926 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ODC1P11926 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODC1P11926 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODC1P11926 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODC1P11926 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODC1P11926 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODC1P11926 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODC1P11926 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ODC1P11926 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODC1P11926 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODC1P11926 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODC1P11926 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODC1P11926 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODC1P11926 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ODC1P11926 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODC1P11926 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODC1P11926 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ODC1P11926 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ODC1P11926 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ODC1P11926 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ODC1P11926 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ODC1P11926 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms