Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IRF1P10914 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF1P10914 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF1P10914 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF1P10914 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF1P10914 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF1P10914 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF1P10914 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF1P10914 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF1P10914 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IRF1P10914 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF1P10914 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF1P10914 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF1P10914 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF1P10914 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF1P10914 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF1P10914 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF1P10914 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IRF1P10914 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF1P10914 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF1P10914 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF1P10914 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF1P10914 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF1P10914 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF1P10914 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF1P10914 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF1P10914 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF1P10914 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IRF1P10914 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF1P10914 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF1P10914 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IRF1P10914 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF1P10914 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF1P10914 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF1P10914 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF1P10914 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF1P10914 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF1P10914 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF1P10914 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF1P10914 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IRF1P10914 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF1P10914 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF1P10914 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF1P10914 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF1P10914 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF1P10914 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
IRF1P10914 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF1P10914 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF1P10914 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF1P10914 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF1P10914 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IRF1P10914 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IRF1P10914 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF1P10914 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF1P10914 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF1P10914 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF1P10914 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF1P10914 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
IRF1P10914 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF1P10914 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF1P10914 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF1P10914 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF1P10914 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF1P10914 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF1P10914 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF1P10914 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IRF1P10914 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF1P10914 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF1P10914 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF1P10914 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF1P10914 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF1P10914 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IRF1P10914 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF1P10914 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF1P10914 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF1P10914 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF1P10914 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
IRF1P10914 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF1P10914 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF1P10914 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF1P10914 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF1P10914 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF1P10914 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF1P10914 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF1P10914 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF1P10914 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IRF1P10914 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF1P10914 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF1P10914 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms