Protein–RNA interactions for Protein: P0DMQ9

C8orf89, Putative uncharacterized protein C8orf89, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf89P0DMQ9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf89P0DMQ9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf89P0DMQ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf89P0DMQ9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf89P0DMQ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf89P0DMQ9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf89P0DMQ9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf89P0DMQ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
C8orf89P0DMQ9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C8orf89P0DMQ9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C8orf89P0DMQ9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms