Protein–RNA interactions for Protein: P06401

PGR, Progesterone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGRP06401 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGRP06401 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGRP06401 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PGRP06401 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGRP06401 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGRP06401 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGRP06401 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGRP06401 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PGRP06401 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGRP06401 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PGRP06401 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PGRP06401 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PGRP06401 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGRP06401 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGRP06401 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PGRP06401 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PGRP06401 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGRP06401 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGRP06401 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGRP06401 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGRP06401 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGRP06401 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PGRP06401 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PGRP06401 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGRP06401 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PGRP06401 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGRP06401 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PGRP06401 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGRP06401 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGRP06401 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGRP06401 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGRP06401 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PGRP06401 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGRP06401 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGRP06401 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGRP06401 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGRP06401 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGRP06401 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PGRP06401 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGRP06401 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGRP06401 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGRP06401 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGRP06401 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PGRP06401 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGRP06401 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGRP06401 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PGRP06401 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGRP06401 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGRP06401 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGRP06401 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PGRP06401 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PGRP06401 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGRP06401 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGRP06401 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGRP06401 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGRP06401 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGRP06401 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGRP06401 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGRP06401 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PGRP06401 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGRP06401 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGRP06401 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PGRP06401 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms