Protein–RNA interactions for Protein: P04554

PRM2, Protamine-2, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM2P04554 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PRM2P04554 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRM2P04554 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRM2P04554 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRM2P04554 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PRM2P04554 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRM2P04554 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRM2P04554 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRM2P04554 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRM2P04554 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRM2P04554 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PRM2P04554 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRM2P04554 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRM2P04554 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRM2P04554 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRM2P04554 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRM2P04554 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PRM2P04554 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PRM2P04554 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRM2P04554 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRM2P04554 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRM2P04554 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PRM2P04554 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRM2P04554 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PRM2P04554 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRM2P04554 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRM2P04554 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRM2P04554 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRM2P04554 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRM2P04554 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRM2P04554 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRM2P04554 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRM2P04554 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRM2P04554 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PRM2P04554 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRM2P04554 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRM2P04554 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRM2P04554 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PRM2P04554 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PRM2P04554 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRM2P04554 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRM2P04554 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRM2P04554 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRM2P04554 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRM2P04554 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRM2P04554 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRM2P04554 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRM2P04554 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PRM2P04554 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRM2P04554 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PRM2P04554 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PRM2P04554 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRM2P04554 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRM2P04554 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PRM2P04554 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms