Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTNP04004 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
VTNP04004 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VTNP04004 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTNP04004 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTNP04004 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTNP04004 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTNP04004 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTNP04004 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTNP04004 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
VTNP04004 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTNP04004 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTNP04004 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
VTNP04004 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
VTNP04004 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTNP04004 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTNP04004 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
VTNP04004 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VTNP04004 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VTNP04004 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTNP04004 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTNP04004 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
VTNP04004 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTNP04004 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTNP04004 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
VTNP04004 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
VTNP04004 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTNP04004 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTNP04004 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTNP04004 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTNP04004 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTNP04004 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
VTNP04004 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTNP04004 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTNP04004 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTNP04004 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTNP04004 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTNP04004 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTNP04004 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTNP04004 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTNP04004 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTNP04004 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTNP04004 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
VTNP04004 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTNP04004 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTNP04004 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTNP04004 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
VTNP04004 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
VTNP04004 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VTNP04004 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VTNP04004 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
VTNP04004 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
VTNP04004 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
VTNP04004 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
VTNP04004 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTNP04004 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTNP04004 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VTNP04004 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTNP04004 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VTNP04004 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
VTNP04004 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTNP04004 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTNP04004 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTNP04004 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
VTNP04004 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTNP04004 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTNP04004 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTNP04004 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTNP04004 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTNP04004 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTNP04004 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
VTNP04004 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTNP04004 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTNP04004 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTNP04004 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTNP04004 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTNP04004 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
VTNP04004 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms