Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP1P03956 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP1P03956 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP1P03956 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MMP1P03956 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP1P03956 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP1P03956 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP1P03956 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP1P03956 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP1P03956 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MMP1P03956 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP1P03956 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP1P03956 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP1P03956 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP1P03956 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP1P03956 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP1P03956 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MMP1P03956 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MMP1P03956 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP1P03956 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP1P03956 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP1P03956 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
MMP1P03956 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP1P03956 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP1P03956 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MMP1P03956 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP1P03956 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP1P03956 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP1P03956 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP1P03956 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP1P03956 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MMP1P03956 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP1P03956 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP1P03956 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP1P03956 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP1P03956 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MMP1P03956 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP1P03956 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MMP1P03956 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP1P03956 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP1P03956 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP1P03956 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP1P03956 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MMP1P03956 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP1P03956 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP1P03956 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP1P03956 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP1P03956 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MMP1P03956 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP1P03956 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP1P03956 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MMP1P03956 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP1P03956 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP1P03956 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP1P03956 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP1P03956 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP1P03956 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MMP1P03956 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP1P03956 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP1P03956 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP1P03956 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP1P03956 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP1P03956 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP1P03956 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP1P03956 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MMP1P03956 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP1P03956 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP1P03956 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP1P03956 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP1P03956 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP1P03956 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MMP1P03956 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP1P03956 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP1P03956 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP1P03956 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MMP1P03956 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP1P03956 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP1P03956 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP1P03956 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP1P03956 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP1P03956 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MMP1P03956 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MMP1P03956 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
MMP1P03956 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP1P03956 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP1P03956 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP1P03956 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP1P03956 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP1P03956 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.6 ms