Protein–RNA interactions for Protein: O95786

DDX58, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX58, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX58O95786 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX58O95786 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX58O95786 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX58O95786 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX58O95786 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX58O95786 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
DDX58O95786 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX58O95786 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX58O95786 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX58O95786 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX58O95786 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
DDX58O95786 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX58O95786 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX58O95786 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX58O95786 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
DDX58O95786 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX58O95786 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
DDX58O95786 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
DDX58O95786 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.4
DDX58O95786 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX58O95786 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX58O95786 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX58O95786 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
DDX58O95786 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
DDX58O95786 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC30■■■□□ 2.39
DDX58O95786 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30■■■□□ 2.39
DDX58O95786 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX58O95786 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX58O95786 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX58O95786 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX58O95786 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX58O95786 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX58O95786 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX58O95786 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
DDX58O95786 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX58O95786 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX58O95786 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX58O95786 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX58O95786 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX58O95786 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX58O95786 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
DDX58O95786 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX58O95786 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX58O95786 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX58O95786 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
DDX58O95786 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX58O95786 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX58O95786 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX58O95786 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX58O95786 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX58O95786 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX58O95786 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX58O95786 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
DDX58O95786 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX58O95786 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX58O95786 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
DDX58O95786 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
DDX58O95786 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX58O95786 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX58O95786 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX58O95786 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
DDX58O95786 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX58O95786 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX58O95786 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX58O95786 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX58O95786 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX58O95786 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX58O95786 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
DDX58O95786 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX58O95786 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX58O95786 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX58O95786 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX58O95786 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
DDX58O95786 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX58O95786 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX58O95786 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
DDX58O95786 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX58O95786 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX58O95786 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX58O95786 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX58O95786 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX58O95786 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX58O95786 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX58O95786 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
DDX58O95786 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX58O95786 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX58O95786 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX58O95786 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX58O95786 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX58O95786 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
DDX58O95786 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
DDX58O95786 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
DDX58O95786 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX58O95786 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX58O95786 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX58O95786 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
DDX58O95786 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX58O95786 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX58O95786 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
DDX58O95786 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms