Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CPNE6O95741 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CPNE6O95741 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms