Protein–RNA interactions for Protein: O94779

CNTN5, Contactin-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN5O94779 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CNTN5O94779 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNTN5O94779 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNTN5O94779 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN5O94779 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNTN5O94779 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN5O94779 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN5O94779 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN5O94779 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN5O94779 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN5O94779 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN5O94779 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNTN5O94779 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms