Protein–RNA interactions for Protein: O75575

CRCP, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRCPO75575 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRCPO75575 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRCPO75575 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CRCPO75575 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CRCPO75575 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CRCPO75575 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRCPO75575 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRCPO75575 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRCPO75575 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRCPO75575 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRCPO75575 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CRCPO75575 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRCPO75575 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRCPO75575 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRCPO75575 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRCPO75575 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRCPO75575 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CRCPO75575 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRCPO75575 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRCPO75575 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRCPO75575 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CRCPO75575 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRCPO75575 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRCPO75575 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRCPO75575 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CRCPO75575 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CRCPO75575 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CRCPO75575 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRCPO75575 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CRCPO75575 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRCPO75575 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRCPO75575 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRCPO75575 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRCPO75575 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRCPO75575 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CRCPO75575 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRCPO75575 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRCPO75575 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRCPO75575 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRCPO75575 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRCPO75575 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRCPO75575 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRCPO75575 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRCPO75575 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRCPO75575 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRCPO75575 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CRCPO75575 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CRCPO75575 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRCPO75575 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRCPO75575 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRCPO75575 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRCPO75575 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRCPO75575 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CRCPO75575 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRCPO75575 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CRCPO75575 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRCPO75575 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRCPO75575 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRCPO75575 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRCPO75575 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRCPO75575 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRCPO75575 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRCPO75575 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRCPO75575 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRCPO75575 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRCPO75575 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CRCPO75575 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRCPO75575 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRCPO75575 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRCPO75575 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRCPO75575 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRCPO75575 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRCPO75575 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRCPO75575 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRCPO75575 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRCPO75575 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CRCPO75575 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRCPO75575 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRCPO75575 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CRCPO75575 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRCPO75575 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRCPO75575 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRCPO75575 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRCPO75575 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CRCPO75575 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CRCPO75575 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms