Protein–RNA interactions for Protein: O75439

PMPCB, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMPCBO75439 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PMPCBO75439 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PMPCBO75439 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PMPCBO75439 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PMPCBO75439 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PMPCBO75439 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PMPCBO75439 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PMPCBO75439 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PMPCBO75439 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PMPCBO75439 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms