Protein–RNA interactions for Protein: O75326

SEMA7A, Semaphorin-7A, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA7AO75326 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SEMA7AO75326 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEMA7AO75326 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEMA7AO75326 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms