Protein–RNA interactions for Protein: O43490

PROM1, Prominin-1, humanhuman

Predictions only

Length 865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM1O43490 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROM1O43490 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROM1O43490 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROM1O43490 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROM1O43490 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROM1O43490 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PROM1O43490 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROM1O43490 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROM1O43490 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROM1O43490 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROM1O43490 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROM1O43490 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROM1O43490 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROM1O43490 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PROM1O43490 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROM1O43490 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROM1O43490 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROM1O43490 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROM1O43490 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROM1O43490 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROM1O43490 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PROM1O43490 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROM1O43490 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PROM1O43490 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PROM1O43490 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROM1O43490 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROM1O43490 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROM1O43490 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PROM1O43490 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PROM1O43490 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PROM1O43490 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PROM1O43490 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PROM1O43490 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PROM1O43490 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PROM1O43490 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM1O43490 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM1O43490 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM1O43490 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM1O43490 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM1O43490 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM1O43490 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM1O43490 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM1O43490 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM1O43490 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM1O43490 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PROM1O43490 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM1O43490 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM1O43490 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PROM1O43490 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PROM1O43490 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM1O43490 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM1O43490 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM1O43490 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM1O43490 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM1O43490 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PROM1O43490 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM1O43490 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM1O43490 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM1O43490 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM1O43490 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM1O43490 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM1O43490 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PROM1O43490 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROM1O43490 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROM1O43490 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROM1O43490 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROM1O43490 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROM1O43490 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PROM1O43490 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROM1O43490 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROM1O43490 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PROM1O43490 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PROM1O43490 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms