Protein–RNA interactions for Protein: O43435

TBX1, T-box transcription factor TBX1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBX1O43435 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX1O43435 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TBX1O43435 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBX1O43435 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TBX1O43435 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBX1O43435 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBX1O43435 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBX1O43435 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TBX1O43435 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBX1O43435 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBX1O43435 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBX1O43435 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBX1O43435 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBX1O43435 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBX1O43435 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBX1O43435 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TBX1O43435 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBX1O43435 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBX1O43435 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBX1O43435 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBX1O43435 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBX1O43435 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBX1O43435 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBX1O43435 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBX1O43435 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBX1O43435 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBX1O43435 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TBX1O43435 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TBX1O43435 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBX1O43435 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBX1O43435 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBX1O43435 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBX1O43435 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBX1O43435 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBX1O43435 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBX1O43435 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TBX1O43435 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBX1O43435 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBX1O43435 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBX1O43435 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TBX1O43435 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBX1O43435 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBX1O43435 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TBX1O43435 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBX1O43435 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
TBX1O43435 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBX1O43435 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBX1O43435 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBX1O43435 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBX1O43435 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBX1O43435 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBX1O43435 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBX1O43435 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TBX1O43435 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TBX1O43435 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBX1O43435 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBX1O43435 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBX1O43435 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBX1O43435 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBX1O43435 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBX1O43435 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBX1O43435 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBX1O43435 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TBX1O43435 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBX1O43435 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBX1O43435 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBX1O43435 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBX1O43435 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBX1O43435 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBX1O43435 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBX1O43435 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBX1O43435 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBX1O43435 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TBX1O43435 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TBX1O43435 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TBX1O43435 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
TBX1O43435 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms