Protein–RNA interactions for Protein: O43295

SRGAP3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,099 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP3O43295 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SRGAP3O43295 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRGAP3O43295 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRGAP3O43295 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
SRGAP3O43295 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms