Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PAPSS1O43252 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PAPSS1O43252 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAPSS1O43252 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PAPSS1O43252 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAPSS1O43252 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAPSS1O43252 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PAPSS1O43252 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAPSS1O43252 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAPSS1O43252 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAPSS1O43252 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PAPSS1O43252 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PAPSS1O43252 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PAPSS1O43252 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms