Protein–RNA interactions for Protein: O43181

NDUFS4, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS4O43181 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NDUFS4O43181 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NDUFS4O43181 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms