Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARPC5O15511 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARPC5O15511 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARPC5O15511 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARPC5O15511 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARPC5O15511 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARPC5O15511 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARPC5O15511 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ARPC5O15511 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARPC5O15511 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARPC5O15511 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ARPC5O15511 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms